PERN świadczy usługę transportu paliw płynnych takich jak benzyny, olej napędowy oraz lekki olej opałowy dalekosiężnymi rurociągami produktowymi. Tłoczenia paliw odbywają się na następujących  trasach:

Płock – Nowa Wieś Wielka – Rejowiec (kierunek: Bydgoszcz – Poznań)

Na trasie z Płocka do Nowej Wsi Wielkiej PERN ma możliwość transportowania rocznie 2,8 mln m³ paliw. Przedłużeniem rurociągu do Rejowca Spółka może przesłać 2,2 mln m³ paliw na rok.

Płock – Mościska – Emilianów (kierunek: Warszawa)

Rurociągiem tym PERN ma możliwość transportowania z Płocka do Mościsk około 2,1 mln m³ a do Emilianowa około 1,5 mln m³ paliw rocznie.

Płock – Koluszki – Boronów (kierunek: Łódź – Częstochowa)

Trasa Płock – Koluszki to najbardziej wydajny odcinek z rurociągów paliwowych PERN S.A. Osiąga on roczną przepustowość na poziomie 4,9 mln m³ paliw, zaś jego przedłużenie z Koluszek do Boronowa około 2,4 mln m³ paliw rocznie.

Pięć największych baz: w Koluszkach, Nowej Wsi Wielkiej, Boronowie, Rejowcu i Emilianowie jest połączonych dalekosiężnymi rurociągami paliwowymi z rafinerią w Płocku. Łączna długość wszystkich odcinków wynosi około 620 kilometrów.