Zur PERN-Unternehmensgruppe gehören fünf Unternehmen:

Naftoport Sp. z o.o. – 66,67 % der Anteile werden von PERN gehalten.

Das Unternehmen führt den Umschlag von Rohöl und Erdölprodukten im Hafen von Danzig durch. Es ist ein wichtiger Baustein in der Logistik der Ölversorgung und des Transits von polnischen und deutschen Raffinerien sowie des Land-See-Umschlags von Ölprodukten. Es ist Polens einziger Offshore-Ölumschlagterminal und der größte inländische Terminal für den Umschlag von raffinierten Ölprodukten sowie einer der größten Ölumschlagterminals an der Ostsee.

Naftor Sp. z o.o. – 100 % der Anteile werden von PERN gehalten.

Dieses Unternehmen ist im Bereich der Sicherheit tätig und darauf ausgerichtet, Projekte im Bereich der physischen Sicherheit und des technischen Schutzes von Einrichtungen, die für das wirtschaftliche Interesse des Staates besonders wichtig sind, durchzuführen.

Naftoserwis Sp. z o.o. – 100 % der Anteile werden von PERN gehalten.

Es ist das polenweit größte Unternehmen, das spezialisierte technische Wartungsdienste für Treibstoffdepots (einschließlich Wartungs- und Reparaturdienste in Depots, Tankreinigung) und Pipeline-Diagnosedienste anbietet.

„Siarkopol” Gdańsk S.A. – 100 % der Aktien werden von PERN gehalten.

Das Unternehmen erbringt Dienstleistungen für die Ausfuhr von fossilem Schwefel aus Polen auf dem Seeweg auf die Weltmärkte. Neben dem Umschlag von Schwefelgranulat bietet das Unternehmen auch Umschlag- und Lagerungsdienste für flüssige petrochemische, chemische und pflanzliche Produkte an.

MPS Sarmatia Sp. z o.o. – 28,8 % der Anteile werden von PERN gehalten.

Es ist eine Zweckgesellschaft, die 2004 von zwei Gesellschaftern, der PERN S.A. und einer ukrainischen Aktiengesellschaft, der „Ukrtransnafta“, im Zuge der Vorbereitung des Euro-Asiatischen Öltransportkorridors gegründet wurde. Derzeit gehören zu den Aktionären (neben den Gründern): Staatliche Ölgesellschaft der Republik Aserbaidschan (SOCAR), Georgische Gesellschaft für Öl und Gas Aktiengesellschaft (GOGC) und litauische AB „Klaipedos Nafta“.